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視頻 | 通過預測ADMET和體內PK參數,快速篩選候選化合物(英文)
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視頻 | 通過預測ADMET和體內PK參數,快速篩選候選化合物(英文)

2020-08-01 09:39:18

背景概要


8月1日凡默谷云課堂《通過預測ADMET和體內PK參數,快速篩選候選化合物》,由美國Simulations Plus高級首席科學家Michael Lawless主講。

課程分三部分開展,第一部分介紹了理化性質預測、藥物代謝預測、轉運體預測模塊,包括pKa,化合物在水中和在模擬胃腸液中的溶解度,表征滲透性的預測參數,血漿蛋白結合率,表觀分布容積等,并展示了如何預測化合物對應pKa在不同pH下的離子化形式和含量,如何快速預測BCS分類等;預測化合物是哪些CYP酶,UGT酶,醛氧化酶的底物,抑制劑,并演示了如何預測代謝位點,代謝產物;預測化合物是哪些轉運體的底物或抑制劑,如P-gp,BCRP, OATP1B1/1B3, OCT1/2, OAT1/3, BSEP。

第二部分講解了如何利用自己已有的實驗數據和文獻中的數據搭建QSAR或QSPR模型,目前主流的人工智能領域,人工神經網絡ANN和支持向量機SVM是最主流的算法,ADMET Predictor自建模型模塊除了這兩種算法,還提供了偏最小二乘法PLS、多重線性回歸MLR的建模方法。展現了搭建良好模型的要素:對數據的收集與分析整理,采用合適和精確的分子描述符,預先過濾不相關的分子描述符,采用外部數據進行模型的驗證,采用合適的算法進行模型的訓練,防止模型過度訓練等。闡述了模型搭建的流程,如何考察模型的準確度、變異、不確定性等。

第三部分講解了快速預測體內PK參數的HTPK模塊,包括吸收百分數Fa, 系統清除率,穩態下的表觀分布容積Vdss, Cmax,CmaxSS, Tmax, TmaxSS,t1/2, AUC等。

內容概要


  • ADMET性質的預測
  • 快速預測體內PK參數
  • 如何搭建良好的性質預測模式

講解人


Michael Lawless,高級首席科學家,美國Simulations Plus
超過20年化學信息與計算化學從業經驗,2011年加入美國Simulations Plus,從事AI驅動新藥研發工具的開發與應用,并與全球多家制藥企業合作不斷完善產品。1988年在美國Arkansas大學取得物理化學博士學位。

視頻



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